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title: Aperçu du workflow d'Analycyte
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graph TD
subgraph Softwares
Z([fa:fa-arrow-up-from-bracket FlowJo])
Y([fa:fa-arrow-up-from-bracket OMIQ])
end
OA(fa:fa-arrow-up-from-bracket .rds file)
subgraph Cells
OB(.fcs concatened file)
OC(.csv/.xlsx features files)
MA(.csv/.xlsx metadata)
end
subgraph analycyte
B1[fa:fa-arrow-up-from-bracket Data Import] --> B2[fa:fa-filter Data Processing]
B1 ~~~ B3[fa:fa-table Phantasus Export]
B2 --> COP[fa:fa-chart-simple Automated Reporting]
subgraph analycyte.projects
COP --> D[QC]
COP --> E[DA]
COP --> F[DS]
end
analycyte.projects ~~~ B4[Project Export]
end
Softwares --- Cells
Cells --> B1
OA --> B1
OB --- MA
OC --- MA
click OB href "qmd/sec_mod_import_concat_fr.html"
click OC href "qmd/sec_mod_import_feature_fr.html"
click B3 href "qmd/sec_mod_export_ph_fr.html"
click OA href "qmd/sec_mod_import_rds_fr.html"
click Z href "qmd/a1-flowjo_fr.html"
click Y href "qmd/a2-omiq_fr.html"
click D href "qmd/sec_mod_qc_fr.html"
click E href "qmd/sec_mod_da_fr.html"
click F href "qmd/sec_mod_ds_fr.html"
click B4 href "qmd/sec_mod_project_to_export_fr.html"
analycyte: simplifier l’analyse post clustering
Bienvenue
analycyte est une application shiny conçue pour améliorer la post-analyse des données de cytométrie et le contrôle de l’utilisateur sur ce processus. Cet outil simplifie le flux de travail et facilite la prise de décision efficace en recherche et en clinique. Les utilisateurs peuvent gérer leurs analyses de manière indépendante, grâce à des rapports personnalisés, modulaires et standardisés.
L’outil prend en charge l’exportation de données depuis OMIQ et FlowJo. Tous les objets R générés par l’application peuvent être facilement réexécutés pour intégrer des actions plus récentes.
analycyte est actuellement en cours de développement
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