Abondance |
La quantité ou la concentration d’un type de cellule ou d’un marqueur spécifique dans un échantillon, mesurée par fichier .fcs individuel. Souvent utilisé pour décrire la présence relative ou absolue de populations de cellules en cytométrie. |
Cluster |
Groupes prédéfinis de cellules similaires basés sur des features ou des mesures spécifiques, utilisés pour analyser des sous-ensembles dans les données de cytométrie. Les groupes sont identifiés avant l’analyse dans l’application. |
Abondance différentielle |
La comparaison des niveaux d’abondance entre différentes conditions ou groupes dans les données de cytométrie afin d’identifier les changements significatifs dans les populations de cellules. |
État différentiel |
L’analyse des changements d’état ou de condition des populations de cellules dans différentes conditions expérimentales, en évaluant les variations au-delà de la simple abondance. Permet de calculer des tests de l’état différentiel des populations de cellules (c’est-à-dire l’expression différentielle des marqueurs de l’état des cellules au sein des groupes). |
FCS |
Fichier de tri cellulaire activé par fluorescence, un format de données qui contient des informations sur chaque cellule individuelle mesurée. |
Gating |
Méthode utilisée pour sélectionner les cellules en fonction de critères spécifiques, ce qui permet d’analyser des sous-populations de cellules. La sélection est effectuée avant l’analyse des données dans l’application. |
Métadonnées |
Informations contextuelles décrivant les données de l’expérience. |
MFI |
L’intensité moyenne de fluorescence est une mesure permettant de quantifier l’intensité moyenne de fluorescence des cellules au sein d’une population sélectionnée, ce qui indique les niveaux d’expression des protéines. |
Marqueurs d’état |
Indicateurs utilisés en cytométrie pour identifier les features transitoires ou conditionnelles des cellules, telles que l’activation ou les réponses au stress, reflétant les états dynamiques des cellules. |
Marqueurs de type |
Marqueurs spécifiques utilisés en cytométrie pour classer les cellules en types ou classes distincts sur la base de leurs propriétés inhérentes, telles que la lignée cellulaire ou les attributs fonctionnels. |